Metabase で FHIR のデータを連携利用する方法
Metabase は、インタラクティブなダッシュボードを作成できるオープンソースのデータ可視化ツールです。CData Connect AI と組み合わせることで、リアルタイムのFHIR のデータにリンクされたビジュアライゼーションやダッシュボードを簡単に作成できます。この記事では、FHIR に接続し、FHIR のデータ を使用してシンプルなビジュアライゼーションを構築する方法を説明します。
CData Connect は FHIR 専用のクラウド間インターフェースを提供し、データをレプリケートすることなく、Metabase でリアルタイムのFHIR のデータを簡単に連携できます。Connect はMetabase からSQL Server データベースと同じように見え、最適化されたデータ処理を標準で使用して、サポートされているすべてのSQL 操作（フィルター、JOIN など）を FHIR に直接プッシュし、サーバーサイド処理を活用してFHIR のデータを迅速に返します。
Metabase 用に FHIR への接続を設定
Metabase から FHIR への接続は、CData Connect AI によって実現されます。Metabase からFHIR のデータを操作するには、まず FHIR 接続を作成し設定します。
- Connect AI にログインして「Sources」をクリックし、 Add Connection をクリックします
- Add Connection パネルから「FHIR」を選択します
-
FHIR への接続に必要な認証プロパティを入力します。
URL をFHIR サーバーのService Base URL に設定します。これは接続したいFHIR サーバーでリソースが定義されているアドレスです。ConnectionType をサポートされている接続タイプに設定します。ContentType をドキュメントのフォーマットに設定します。AuthScheme をFHIR サーバーの認証要件に基づいて設定します。
汎用、Azure ベース、AWS ベース、およびGoogle ベースのFHIR サーバー実装がサポートされます。
Service Base URL のサンプル
- 汎用：http://my_fhir_server/r4b/
- Azure：https://MY_AZURE_FHIR.azurehealthcareapis.com/
- AWS：https://healthlake.REGION.amazonaws.com/datastore/DATASTORE_ID/r4/
- Google：https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/
汎用FHIR インスタンス
CData 製品はFHIR のカスタムインスタンスへの接続をサポートします。カスタムFHIR サーバーへの認証はOAuth で行います（OAuth の詳細はヘルプドキュメントを参照してください）。カスタムFHIR インスタンスに接続する前に、ConnectionType をGenericに設定する必要があります。
- Save & Test をクリックします
-
Add FHIR Connection ページの「Permissions」タブに移動し、ユーザーベースの権限を更新します。
Personal Access Token の追加
REST API、OData API、またはVirtual SQL Server 経由でConnect AI に接続する場合、Personal Access Token（PAT）を使用してConnect AI への接続を認証します。アクセス管理の粒度を維持するために、サービスごとに個別のPAT を作成することをお勧めします。
- Connect AI アプリの右上にある歯車アイコン（）をクリックして設定ページを開きます。
- Settings ページで「Access Tokens」セクションに移動し、 Create PAT をクリックします。
-
PAT に名前を付けて「Create」をクリックします。
- Personal Access Token は作成時にのみ表示されるため、必ずコピーして安全な場所に保存してください。
接続の設定とPAT の生成が完了したら、Metabase からFHIR のデータに接続する準備が整いました。
Metabase からCData Connect AI に接続
Connect AI で接続を作成したら、Metabase インスタンスに移動します。SQL Server インターフェースを使用してConnect AI に接続します。
- 管理画面（Settings -> Admin）に移動し、「Databases」タブから「Add Database」をクリックします
- Connect AI への接続を設定し、「Save」をクリックします
- Database type: 「SQL Server」を選択します
- Name: 接続に名前を付けます（例：「FHIR (Connect AI)」）
- Host: tds.cdata.com
- Port: 14333
- Database name: 先ほど作成した接続の名前（例：FHIR1）
- Username: Connect AI のユーザー名（例：user@mydomain.com）
- Password: 先ほど作成したPAT
- Use a secure connection (SSL) にチェックを入れます
Metabase で FHIR のデータを実行
Connect AI への接続を設定したら、FHIR にクエリを実行してビジュアライゼーションを構築できます。
- 「Write SQL」ツールを使用してFHIR のデータを取得します
- CData Connect AI の FHIR 接続に基づいてSQL クエリを記述します。例：
SELECT Id, [name-use] FROM Patient WHERE [address-city] = 'New York'
- 「Visualization」画面に移動し、ビジュアライゼーションを選択して設定します
詳細情報と無償トライアル
これで、Metabase でFHIR のデータからシンプルなビジュアライゼーションを構築できました。Metabase では、SQL Server データベースと同じようにリアルタイムのFHIR のデータを引き続き操作できます。FHIR（およびその他100以上のデータソース）へのリアルタイム接続の詳細については、Connect AI ページをご覧ください。無償トライアルに登録して、今すぐMetabase でリアルタイムのFHIR のデータを活用してみてください。