Jaspersoft Studio から FHIR のデータに接続

Jerod Johnson
Senior Technology Evangelist

Jaspersoft Studio でFHIR のデータにSQL を実行。

この記事では、CData JDBC Driver for FHIR を使って、Jaspersoft Studio からFHIR に標準JDBC データソースとして接続する方法を説明します。標準のJaspersoft ウィザードを使ってFHIR へのSQL クエリを作成していきます。クエリは直接FHIR API に実行されるため、FHIR のデータへのリアルタイム接続が可能になります。

FHIR のデータにJDBC データソースとして接続

Jaspersoft Studio でJDBC データソースを作成するには、データアダプタを作成します。

Repository Explorer ビューで、Data Adapters ノードを右クリックし、Create Data Adapter をクリックします。
Database JDBC Connection を選択します。
ドライバーのわかりやすい名前を入力します。
Driver Classpath タブで、Add をクリックします。表示されたダイアログで、インストールディレクトリのlib サブフォルダに移動し、ドライバーJAR を選択します。
Database Location タブで、JDBC ドライバーのクラス名を入力します：cdata.jdbc.fhir.FHIRDriver
JDBC URL を入力します。
URL をFHIR サーバーのService Base URL に設定します。これは接続したいFHIR サーバーでリソースが定義されているアドレスです。ConnectionType をサポートされている接続タイプに設定します。ContentType をドキュメントのフォーマットに設定します。AuthScheme をFHIR サーバーの認証要件に基づいて設定します。

汎用、Azure ベース、AWS ベース、およびGoogle ベースのFHIR サーバー実装がサポートされます。

Service Base URL のサンプル
- 汎用：http://my_fhir_server/r4b/
- Azure：https://MY_AZURE_FHIR.azurehealthcareapis.com/
- AWS：https://healthlake.REGION.amazonaws.com/datastore/DATASTORE_ID/r4/
- Google：https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/
汎用FHIR インスタンス

CData 製品はFHIR のカスタムインスタンスへの接続をサポートします。カスタムFHIR サーバーへの認証はOAuth で行います（OAuth の詳細はヘルプドキュメントを参照してください）。カスタムFHIR インスタンスに接続する前に、ConnectionType をGenericに設定する必要があります。

組み込みの接続文字列デザイナー

JDBC URL の構成をサポートするために、FHIR JDBC Driver に組み込まれている接続文字列デザイナーを使用してください。JAR ファイルをダブルクリックするか、コマンドラインからjar ファイルを実行します。
```
java -jar cdata.jdbc.fhir.jar
```
接続プロパティに値を入力して、接続文字列をクリップボードにコピーします。

JDBC URL を構成する際に、Max Rows 接続プロパティも設定できます。これにより返される行数が制限され、レポートやビジュアライゼーションの設計時のパフォーマンス向上に役立ちます。

以下はFHIR の一般的なJDBC URL です：
```
jdbc:fhir:URL=http://test.fhir.org/r4b/;ConnectionType=Generic;ContentType=JSON;AuthScheme=None;
```

FHIR のデータでレポートを作成

以下のステップに従って、FHIR へのSQL クエリを作成します。これはシンプルなレポートの基礎となります。

File -> New Jasper Report をクリックします。テンプレートを選択し、親プロジェクトを選択して、レポートファイルを指定します。
Data Adapter メニューで、前のセクションで作成したデータアダプタを選択します。
Diagram タブで、テーブルをボックスにドラッグして、使用したいカラムをクリックします。または、Texts タブでカスタムクエリを入力します。例：
```
SELECT Id, [name-use] FROM Patient WHERE [address-city] = 'New York'
```
データセットに含めるフィールドを選択します。この例では、すべてのフィールドを使用します。
Group By ステップをスキップして、ウィザードを完了します。

Preview タブで、現在のFHIR のデータでレポートがどのように表示されるかをプレビューできます。

リアルタイムデータが入力されたJasperReport テンプレート（図はSalesforce）

チャートを作成

以下のセクションでは、独自のSQL クエリに紐づいたチャートを作成する方法を説明します。リモートデータソースからデータを取得する際、特定のレポートオブジェクト用に作成したより制限的なクエリを使用すると、パフォーマンスが向上する場合があります。

DataSet を作成

以下のステップに従って、チャートを入力する新しいデータセットを作成します。

レポートの編集エリアで、Design タブをクリックします。
Outline ビューで、レポートのルートノードを右クリックし、Create Dataset をクリックします。
データセットの名前を入力し、接続またはデータソースから新しいデータセットを作成するオプションをクリックします。
Data Adapter メニューで、最初のセクションで作成したデータアダプタを選択します。

次のようなクエリを入力します：

SELECT Id, [name-use] FROM Patient WHERE [address-city] = 'New York'

データセットに含めるフィールドを選択します。この例ではId と[name-use] を使用します。
フィールドによるグループ化のステップをスキップして、ウィザードを完了します。

チャートを構成

データセットを追加した後、以下のステップに従ってチャートウィザードでカラム値をチャートの軸にマッピングします。

Outline ビューでSummary ノードをクリックします。Properties ビューで、高さを400ピクセルに設定します。Summary バンドはレポートの最後に印刷されます。
パレットからチャートをSummary にドラッグします。チャートウィザードが表示されます。
チャートのタイプを選択します。この例では棒グラフを使用します。
Dataset メニューで、チャート用に作成したデータセットを選択します。
Dataset タブで、マスターレポートの入力に使用されたものと同じJDBC 接続を使用するオプションを選択します。
チャートのシリーズを指定します：Series メニューの横にあるボタンをクリックし、Add をクリックします。表示されたExpression Editor で、Id カラムをダブルクリックして、式を$F{Id} に設定します。
y 軸の値を指定します：チャートウィザードで、Value ボックスの横にあるボタンをクリックします。Expression Editor で、[name-use] をダブルクリックして、式を$F{[name-use]} に設定します。
シリーズ要素のラベルを指定します：チャートウィザードで、Label ボックスの横にあるボタンをクリックします。Expression Editor で、Id カラムをダブルクリックして、式を$F{Id} に設定します。必要に応じて、以下の式のようにカラムの型を文字列に変換します：
```
$F{Id}.toString()
```
チャートを拡大してSummary セクションを埋めます：チャートを右クリックして、Size to Container -> Fit Both をクリックします。