R から JDBC 経由でRedshiftののデータを分析
R と Java がインストールされている環境であれば、純粋な R スクリプトと標準的な SQL を使用してRedshift のデータにアクセスできます。CData JDBC Driver for Redshift と RJDBC パッケージを使えば、R からリモートのRedshift のデータを操作できます。CData Driver を使用することで、業界で実績のある標準規格に準拠したドライバーを活用し、人気のオープンソース言語 R でデータにアクセスできます。この記事では、ドライバーを使ってRedshiftに SQL クエリを実行し、標準的な R 関数を呼び出してRedshift のデータを可視化する方法を説明します。
R のインストール
マルチスレッドとマネージドコードによるドライバーのパフォーマンス向上を最大限に活かすには、マルチスレッド対応の Microsoft R Open を使用するか、BLAS/LAPACK ライブラリとリンクされたオープンソース R を使用します。この記事では Microsoft R Open 3.2.3 を使用しています。このバージョンは、2016年1月1日時点の CRAN リポジトリのスナップショットからパッケージをインストールするように事前設定されており、再現性が確保されています。
RJDBC パッケージの読み込み
ドライバーを使用するには、RJDBC パッケージをダウンロードしてください。 RJDBC パッケージをインストールしたら、以下のコードでパッケージを読み込みます。
library(RJDBC)
Redshiftに JDBC データソースとして接続
Redshiftに JDBC データソースとして接続するには、以下の情報が必要です。
- Driver Class: cdata.jdbc.redshift.RedshiftDriver に設定します。
- Classpath: ドライバー JAR ファイルの場所を設定します。デフォルトでは、インストールフォルダの lib サブフォルダです。
dbConnect や dbSendQuery などの DBI 関数は、R でデータアクセスコードを記述するための統一されたインターフェースを提供します。以下のコードで、CData JDBC Driver for Redshift に JDBC リクエストを行う DBI ドライバーを初期化します。
driver <- JDBC(driverClass = "cdata.jdbc.redshift.RedshiftDriver", classPath = "MyInstallationDir\lib\cdata.jdbc.redshift.jar", identifier.quote = "'")
これで DBI 関数を使用してRedshiftに接続し、SQL クエリを実行できます。dbConnect 関数で JDBC 接続を初期化します。
Amazon Redshift への接続
それでは、早速Amazon Redshift に接続していきましょう。データに接続するには、以下の接続パラメータを指定します。
- Server:Amazon Redshift データベースをホスティングしているサーバーのホスト名またはIP アドレス
- Database:Amazon Redshift クラスター用に作成したデータベース
- Port(オプション):Amazon Redshift データベースをホスティングしているサーバーのポート。デフォルトは5439です
これらの値は、以下のステップでAWS マネージメントコンソールから取得できます。
- Amazon Redshift コンソールを開きます(http://console.aws.amazon.com/redshift)
- Clusters ページで、クラスター名をクリックしてください
- Configuration タブの"Cluster Database Properties" セクションからプロパティを取得します。接続プロパティの値は、ODBC URL で設定された値と同じになります
Amazon Redshiftへの認証
CData 製品では幅広い認証オプションに対応しています。標準認証情報からIAM クレデンシャル、ADFS、Ping Federate、Microsoft Entra ID(Azure AD)、Azure AD PKCE まで利用可能です。標準認証
ログイン資格情報を使用してAmazon Redshift に接続するには、以下のプロパティを設定してみましょう。- AuthScheme:Basic
- User:認証するユーザーのログイン情報
- Password:認証するユーザーのパスワード
その他の認証方法については、ヘルプドキュメントをご確認ください。
組み込みの接続文字列デザイナー
JDBC URL の構築には、Redshift JDBC Driver に組み込まれている接続文字列デザイナーが便利です。JAR ファイルをダブルクリックするか、コマンドラインから JAR ファイルを実行してください。
java -jar cdata.jdbc.redshift.jar
接続プロパティを入力し、接続文字列をクリップボードにコピーします。
以下は、一般的な JDBC 接続文字列を含む dbConnect 呼び出しの例です。
conn <- dbConnect(driver,"jdbc:redshift:User=admin;Password=admin;Database=dev;Server=examplecluster.my.us-west-2.redshift.amazonaws.com;Port=5439;")
スキーマの検出
このドライバーは、Redshift API をリレーショナルテーブル、ビュー、ストアドプロシージャとしてモデル化します。以下のコードでテーブルの一覧を取得できます。
dbListTables(conn)
SQL クエリの実行
dbGetQuery 関数を使用して、Redshift API でサポートされている任意の SQL クエリを実行できます。
orders <- dbGetQuery(conn,"SELECT ShipName, ShipCity FROM Orders")
以下のコマンドで、結果をデータビューアウィンドウに表示できます。
View(orders)
Redshift のデータのプロット
これで、CRAN リポジトリで利用可能なデータ可視化パッケージを使ってRedshift のデータを分析できます。組み込みのバープロット関数でシンプルな棒グラフを作成できます。
par(las=2,ps=10,mar=c(5,15,4,2)) barplot(orders$ShipCity, main="Redshift Orders", names.arg = orders$ShipName, horiz=TRUE)