ODBC 経由で R から Parquet のデータ を分析

Jerod Johnson
Jerod Johnson
Senior Technology Evangelist
Microsoft R Open で Parquet のデータ のデータビジュアライゼーションを作成し、高性能な統計関数で分析。

純粋な R スクリプトと標準 SQL で Parquet のデータ にアクセスできます。CData ODBC ドライバ for Parquet と RODBC パッケージを使用すると、R からリモート Parquet のデータ を操作できます。CData ドライバを使用することで、業界で実績のある標準に準拠したドライバを活用し、人気のオープンソース言語 R でデータにアクセスできます。この記事では、ドライバを使用して Parquet のデータ に SQL クエリを実行し、R で Parquet のデータ を可視化する方法を説明します。

R をインストール

マルチスレッドや管理コードによるドライバのパフォーマンス向上は、マルチスレッド対応の Microsoft R Open や、BLAS/LAPACK ライブラリにリンクした R を実行することで補完できます。この記事では Microsoft R Open(MRO)を使用します。

Parquet にODBC データソースとして接続

Parquet への接続情報と、Windows および Linux 環境での DSN 設定手順を説明します。

Parquet 接続プロパティの取得・設定方法

ローカルのParquet ファイルに接続するには、URI 接続プロパティをParquet ファイルへのパスに設定してください。

DSN を設定する際に、Max Rows 接続プロパティも設定することをお勧めします。これにより返される行数が制限され、レポートやビジュアライゼーションの設計時のパフォーマンス向上に役立ちます。

Windows

まだ設定していない場合は、ODBC DSN(データソース名)で接続プロパティを指定します。これはドライバーインストールの最後のステップです。Microsoft ODBC データソースアドミニストレーターを使用して、ODBC DSN を作成・設定できます。

Linux

Linux 環境で CData ODBC Driver for Parquet をインストールする場合、ドライバーのインストール時にシステム DSN が事前定義されます。システムデータソースファイル(/etc/odbc.ini)を編集して、必要な接続プロパティを定義することで DSN を変更できます。

/etc/odbc.ini

[CData Parquet Source]
Driver = CData ODBC Driver for Parquet
Description = My Description
URI = C:/folder/table.parquet

これらの設定ファイルの使用方法の詳細については、ヘルプドキュメント(インストール済みまたはオンライン)を参照してください。

RODBC パッケージを読み込む

ドライバを使用するには、RODBC パッケージをダウンロードします。RStudio で、[ツール] -> [パッケージのインストール]をクリックし、[パッケージ]ボックスに RODBC と入力します。

RODBC パッケージをインストールした後、以下の行でパッケージを読み込みます。

library(RODBC)

注意:この記事では RODBC バージョン 1.3-12 を使用しています。Microsoft R Open を使用すると、Microsoft の MRAN リポジトリのチェックポイント機能を使用して同じバージョンでテストできます。 checkpoint コマンドを使用すると、MRAN リポジトリでホストされている CRAN リポジトリのスナップショットからパッケージをインストールできます。2016年1月1日のスナップショットにはバージョン 1.3-12 が含まれています。

library(checkpoint)
checkpoint("2016-01-01")

Parquet のデータ にODBC データソースとして接続

以下の行で R から DSN に接続できます。

conn <- odbcConnect("CData Parquet Source")

スキーマの検出

ドライバは Parquet API をリレーショナルテーブル、ビュー、ストアドプロシージャとしてモデル化します。以下の行でテーブルの一覧を取得できます。

sqlTables(conn)

SQL クエリを実行

sqlQuery 関数を使用して、Parquet API でサポートされている任意の SQL クエリを実行できます。

sampletable_1 <- sqlQuery(conn, "SELECT Id, Column1 FROM SampleTable_1 WHERE Column2 = 'SAMPLE_VALUE'", believeNRows=FALSE, rows_at_time=1)

以下のコマンドでデータビューアウィンドウに結果を表示できます。

View(sampletable_1)

Parquet のデータ をプロット

これで、CRAN リポジトリで利用可能なデータビジュアライゼーションパッケージを使用して Parquet のデータ を分析できます。組み込みのバープロット関数を使用して、シンプルな棒グラフを作成できます。

par(las=2,ps=10,mar=c(5,15,4,2))
barplot(sampletable_1$Column1, main="Parquet SampleTable_1", names.arg = sampletable_1$Id, horiz=TRUE)

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