R から JDBC 経由でNeo4Jののデータを分析

R と Java がインストールされている環境であれば、純粋な R スクリプトと標準的な SQL を使用してNeo4J のデータにアクセスできます。CData JDBC Driver for Neo4J と RJDBC パッケージを使えば、R からリモートのNeo4J のデータを操作できます。CData Driver を使用することで、業界で実績のある標準規格に準拠したドライバーを活用し、人気のオープンソース言語 R でデータにアクセスできます。この記事では、ドライバーを使ってNeo4Jに SQL クエリを実行し、標準的な R 関数を呼び出してNeo4J のデータを可視化する方法を説明します。

R のインストール

マルチスレッドとマネージドコードによるドライバーのパフォーマンス向上を最大限に活かすには、マルチスレッド対応の Microsoft R Open を使用するか、BLAS/LAPACK ライブラリとリンクされたオープンソース R を使用します。この記事では Microsoft R Open 3.2.3 を使用しています。このバージョンは、2016年1月1日時点の CRAN リポジトリのスナップショットからパッケージをインストールするように事前設定されており、再現性が確保されています。

RJDBC パッケージの読み込み

ドライバーを使用するには、RJDBC パッケージをダウンロードしてください。 RJDBC パッケージをインストールしたら、以下のコードでパッケージを読み込みます。

library(RJDBC)

Neo4Jに JDBC データソースとして接続

Neo4Jに JDBC データソースとして接続するには、以下の情報が必要です。

• Driver Class: cdata.jdbc.neo4j.Neo4jDriver に設定します。
• Classpath: ドライバー JAR ファイルの場所を設定します。デフォルトでは、インストールフォルダの lib サブフォルダです。

dbConnect や dbSendQuery などの DBI 関数は、R でデータアクセスコードを記述するための統一されたインターフェースを提供します。以下のコードで、CData JDBC Driver for Neo4J に JDBC リクエストを行う DBI ドライバーを初期化します。

driver <- JDBC(driverClass = "cdata.jdbc.neo4j.Neo4jDriver", classPath = "MyInstallationDir\lib\cdata.jdbc.neo4j.jar", identifier.quote = "'")

これで DBI 関数を使用してNeo4Jに接続し、SQL クエリを実行できます。dbConnect 関数で JDBC 接続を初期化します。

Neo4j に接続するには、次の接続プロパティを設定します。

• Server：Neo4j インスタンスをホスティングしているサーバー。
• Port：Neo4j サービスが稼働しているポート。プロバイダーは、デフォルトでHTTP (7474) ポートに接続します。
• User：Neo4j インスタンスを使用しているユーザーのユーザー名。
• Password：Neo4j インスタンスを使用しているユーザーのパスワード。
• Database：Neo4j インスタンスで対象とするデータベース。デフォルトは"neo4j" です。

組み込みの接続文字列デザイナー

JDBC URL の構築には、Neo4J JDBC Driver に組み込まれている接続文字列デザイナーが便利です。JAR ファイルをダブルクリックするか、コマンドラインから JAR ファイルを実行してください。

java -jar cdata.jdbc.neo4j.jar

接続プロパティを入力し、接続文字列をクリップボードにコピーします。

以下は、一般的な JDBC 接続文字列を含む dbConnect 呼び出しの例です。

conn <- dbConnect(driver,"jdbc:neo4j:Server=localhost;Port=7474;User=my_user;Password=my_password;")

スキーマの検出

このドライバーは、Neo4J API をリレーショナルテーブル、ビュー、ストアドプロシージャとしてモデル化します。以下のコードでテーブルの一覧を取得できます。

dbListTables(conn)

SQL クエリの実行

dbGetQuery 関数を使用して、Neo4J API でサポートされている任意の SQL クエリを実行できます。

productcategory <- dbGetQuery(conn,"SELECT CategoryId, CategoryName FROM ProductCategory WHERE CategoryOwner = 'CData Software'")

以下のコマンドで、結果をデータビューアウィンドウに表示できます。

View(productcategory)

Neo4J のデータのプロット

これで、CRAN リポジトリで利用可能なデータ可視化パッケージを使ってNeo4J のデータを分析できます。組み込みのバープロット関数でシンプルな棒グラフを作成できます。

par(las=2,ps=10,mar=c(5,15,4,2))
barplot(productcategory$CategoryName, main="Neo4J ProductCategory", names.arg = productcategory$CategoryId, horiz=TRUE)