R から JDBC 経由でGoogle Cloud Storageののデータを分析
R と Java がインストールされている環境であれば、純粋な R スクリプトと標準的な SQL を使用してGoogle Cloud Storage のデータにアクセスできます。CData JDBC Driver for Google Cloud Storage と RJDBC パッケージを使えば、R からリモートのGoogle Cloud Storage のデータを操作できます。CData Driver を使用することで、業界で実績のある標準規格に準拠したドライバーを活用し、人気のオープンソース言語 R でデータにアクセスできます。この記事では、ドライバーを使ってGoogle Cloud Storageに SQL クエリを実行し、標準的な R 関数を呼び出してGoogle Cloud Storage のデータを可視化する方法を説明します。
R のインストール
マルチスレッドとマネージドコードによるドライバーのパフォーマンス向上を最大限に活かすには、マルチスレッド対応の Microsoft R Open を使用するか、BLAS/LAPACK ライブラリとリンクされたオープンソース R を使用します。この記事では Microsoft R Open 3.2.3 を使用しています。このバージョンは、2016年1月1日時点の CRAN リポジトリのスナップショットからパッケージをインストールするように事前設定されており、再現性が確保されています。
RJDBC パッケージの読み込み
ドライバーを使用するには、RJDBC パッケージをダウンロードしてください。 RJDBC パッケージをインストールしたら、以下のコードでパッケージを読み込みます。
library(RJDBC)
Google Cloud Storageに JDBC データソースとして接続
Google Cloud Storageに JDBC データソースとして接続するには、以下の情報が必要です。
- Driver Class: cdata.jdbc.googlecloudstorage.GoogleCloudStorageDriver に設定します。
- Classpath: ドライバー JAR ファイルの場所を設定します。デフォルトでは、インストールフォルダの lib サブフォルダです。
dbConnect や dbSendQuery などの DBI 関数は、R でデータアクセスコードを記述するための統一されたインターフェースを提供します。以下のコードで、CData JDBC Driver for Google Cloud Storage に JDBC リクエストを行う DBI ドライバーを初期化します。
driver <- JDBC(driverClass = "cdata.jdbc.googlecloudstorage.GoogleCloudStorageDriver", classPath = "MyInstallationDir\lib\cdata.jdbc.googlecloudstorage.jar", identifier.quote = "'")
これで DBI 関数を使用してGoogle Cloud Storageに接続し、SQL クエリを実行できます。dbConnect 関数で JDBC 接続を初期化します。
ユーザーアカウントでの認証
ユーザー資格情報の接続プロパティを設定することなく接続できます。InitiateOAuth をGETANDREFRESH に設定したら、接続の準備が完了です。
接続すると、Google Cloud Storage OAuth エンドポイントがデフォルトブラウザで開きます。ログインして権限を付与すると、OAuth プロセスが完了します。
サービスアカウントでの認証
サービスアカウントには、ブラウザでユーザー認証を行わないサイレント認証があります。サービスアカウントを使用して、企業全体のアクセススコープを委任することもできます。
このフローでは、OAuth アプリケーションを作成する必要があります。詳しくは、ヘルプドキュメントを参照してください。以下の接続プロパティを設定したら、接続の準備が完了です:
- InitiateOAuth: GETANDREFRESH に設定。
- OAuthJWTCertType: PFXFILE に設定。
- OAuthJWTCert: 生成した.p12 ファイルへのパスに設定。
- OAuthJWTCertPassword: .p12 ファイルのパスワードに設定。
- OAuthJWTCertSubject: 証明書ストアの最初の証明書が選ばれるように"*" に設定。
- OAuthJWTIssuer: 「サービスアカウント」セクションで「サービスアカウントの管理」をクリックし、このフィールドをサービスアカウントID フィールドに表示されているE メールアドレスに設定。
- OAuthJWTSubject: サブジェクトタイプが"enterprise" に設定されている場合はエンタープライズID に設定し、"user" に設定されている場合はアプリユーザーID に設定。
- ProjectId: 接続するプロジェクトのID に設定。
これで、サービスアカウントのOAuth フローが完了します。
組み込みの接続文字列デザイナー
JDBC URL の構築には、Google Cloud Storage JDBC Driver に組み込まれている接続文字列デザイナーが便利です。JAR ファイルをダブルクリックするか、コマンドラインから JAR ファイルを実行してください。
java -jar cdata.jdbc.googlecloudstorage.jar
接続プロパティを入力し、接続文字列をクリップボードにコピーします。
以下は、一般的な JDBC 接続文字列を含む dbConnect 呼び出しの例です。
conn <- dbConnect(driver,"jdbc:googlecloudstorage:ProjectId='project1';")
スキーマの検出
このドライバーは、Google Cloud Storage API をリレーショナルテーブル、ビュー、ストアドプロシージャとしてモデル化します。以下のコードでテーブルの一覧を取得できます。
dbListTables(conn)
SQL クエリの実行
dbGetQuery 関数を使用して、Google Cloud Storage API でサポートされている任意の SQL クエリを実行できます。
buckets <- dbGetQuery(conn,"SELECT Name, OwnerId FROM Buckets WHERE Name = 'TestBucket'")
以下のコマンドで、結果をデータビューアウィンドウに表示できます。
View(buckets)
Google Cloud Storage のデータのプロット
これで、CRAN リポジトリで利用可能なデータ可視化パッケージを使ってGoogle Cloud Storage のデータを分析できます。組み込みのバープロット関数でシンプルな棒グラフを作成できます。
par(las=2,ps=10,mar=c(5,15,4,2)) barplot(buckets$OwnerId, main="Google Cloud Storage Buckets", names.arg = buckets$Name, horiz=TRUE)