MySQL Workbench で FHIR のデータをクエリする方法

Jerod Johnson
Jerod Johnson
Senior Technology Evangelist
MySQL Workbench から FHIR のデータ にMySQL クエリを実行。

FHIR 用のODBC Driver のSQL Gateway を使用すると、MySQL インターフェースを通じて FHIR のデータ にクエリできます。以下の手順に従って、SQL Gateway のMySQL リモーティングサービスを起動し、MySQL Workbench でリアルタイムの FHIR のデータ を操作してみましょう。

FHIR のデータへの接続

まだ接続設定を行っていない場合は、データソース名(DSN)で必要な接続プロパティの値を入力してください。組み込みのMicrosoft ODBC データソースアドミニストレーターを使用してDSN を設定できます。これはドライバーインストールの最後のステップでもあります。Microsoft ODBC データソースアドミニストレーターを使用してDSN を作成・設定する方法については、ヘルプドキュメントの「はじめに」セクションを参照してください。

URL をFHIR サーバーのService Base URL に設定します。これは接続したいFHIR サーバーでリソースが定義されているアドレスです。ConnectionType をサポートされている接続タイプに設定します。ContentType をドキュメントのフォーマットに設定します。AuthScheme をFHIR サーバーの認証要件に基づいて設定します。

汎用、Azure ベース、AWS ベース、およびGoogle ベースのFHIR サーバー実装がサポートされます。

Service Base URL のサンプル

  • 汎用:http://my_fhir_server/r4b/
  • Azure:https://MY_AZURE_FHIR.azurehealthcareapis.com/
  • AWS:https://healthlake.REGION.amazonaws.com/datastore/DATASTORE_ID/r4/
  • Google:https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/

汎用FHIR インスタンス

CData 製品はFHIR のカスタムインスタンスへの接続をサポートします。カスタムFHIR サーバーへの認証はOAuth で行います(OAuth の詳細はヘルプドキュメントを参照してください)。カスタムFHIR インスタンスに接続する前に、ConnectionTypeGenericに設定する必要があります。

SQL Gateway の設定

SQL Gateway の概要を参照して、FHIR のデータ への接続を仮想MySQL データベースとしてセットアップしてください。クライアントからのMySQL リクエストをリッスンするMySQL リモーティングサービスを設定します。このサービスはSQL Gateway UI で設定できます。

SQL Gateway でMySQL リモーティングサービスを作成(Salesforce の例)

MySQL Workbench から FHIR をクエリ

以下の手順では、SQL Gateway で作成した仮想 FHIR データベースにMySQL Workbench から接続し、基本的なクエリを発行してリアルタイムの FHIR のデータ を操作する方法を説明します。

SQL Gateway 経由で FHIR に接続

  1. MySQL Workbench で、新しいMySQL 接続を追加するためにクリックします。
  2. 接続に名前を付けます(CData SQL Gateway for FHIR)。
  3. SQL Gateway に接続するためのHostnamePortUsername パラメータを設定します。
  4. Store in Vault をクリックしてパスワードを設定・保存します。
  5. Test Connection をクリックして接続が正しく設定されていることを確認し、OK をクリックします。

NOTE: Username および Password は、SQL Gateway 用に作成したユーザーの資格情報を指します。

FHIR のデータをクエリ

  1. 作成した接続(CData SQL Gateway for FHIR)を開きます。
  2. File -> New Query Tab をクリックします。
  3. SELECT * FROM `CData FHIR Sys`.Patient; のようなSQL クエリを記述して FHIR のデータ を取得します。

MySQL Workbench からリアルタイムの FHIR のデータ にアクセスできるようになりました。MySQL データベースと同じ感覚で FHIR を簡単に操作できます。CData ODBC Driver for FHIR とCData SQL Gateway の30日間の無償トライアルをぜひお試しください。

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FHIR ODBC ドライバーは、ODBC 接続をサポートする任意のアプリケーションからリアルタイムなFHIR アカウントデータに直接接続できるパワフルなツールです。標準のODBC ドライバーインタフェースを使用して、データベースのようにFHIR データにアクセスし、読み、書き、更新を実行できます。