Tomcat のコネクションプールで CData JDBC Driver for FHIR を構成

CData JDBC Driver は、JVM 上で動作するWeb アプリケーションと連携するための標準JDBC インターフェースをサポートしています。ここでは、Tomcat のコネクションプールから FHIR のデータ に接続する方法を説明します。

Tomcat のコネクションプールから FHIR のデータ に接続

1. CData JAR ファイルと CData .lic ファイルを $CATALINA_HOME/lib にコピーします。CData JAR ファイルは、インストールディレクトリの lib サブフォルダにあります。
2. コンテキストにリソースの定義を追加します。ここでJDBC URL を指定します。

   URL をFHIR サーバーのService Base URL に設定します。これは接続したいFHIR サーバーでリソースが定義されているアドレスです。ConnectionType をサポートされている接続タイプに設定します。ContentType をドキュメントのフォーマットに設定します。AuthScheme をFHIR サーバーの認証要件に基づいて設定します。

   汎用、Azure ベース、AWS ベース、およびGoogle ベースのFHIR サーバー実装がサポートされます。

   Service Base URL のサンプル

   • 汎用：http://my_fhir_server/r4b/
   • Azure：https://MY_AZURE_FHIR.azurehealthcareapis.com/
   • AWS：https://healthlake.REGION.amazonaws.com/datastore/DATASTORE_ID/r4/
   • Google：https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/

   汎用FHIR インスタンス

   CData 製品はFHIR のカスタムインスタンスへの接続をサポートします。カスタムFHIR サーバーへの認証はOAuth で行います（OAuth の詳細はヘルプドキュメントを参照してください）。カスタムFHIR インスタンスに接続する前に、ConnectionType をGenericに設定する必要があります。

   組み込みの接続文字列デザイナー

   JDBC URL の構成については、FHIR JDBC Driver に組み込まれている接続文字列デザイナーを使用してください。JAR ファイルをダブルクリックするか、コマンドラインからJAR ファイルを実行します。

   java -jar cdata.jdbc.fhir.jar
   

   接続プロパティを入力し、接続文字列をクリップボードにコピーします。

   

   以下のリソース定義で指定されたJDBC URL を確認できます。

   
   <Resource name="jdbc/fhir"   auth="Container" type="javax.sql.DataSource" driverClassName="cdata.jdbc.fhir.FHIRDriver" factory="org.apache.tomcat.jdbc.pool.DataSourceFactory" url="jdbc:fhir:URL=http://test.fhir.org/r4b/;ConnectionType=Generic;ContentType=JSON;AuthScheme=None;" maxActive="20" maxIdle="10" maxWait="-1" />
   

   特定のアプリケーションのみに FHIR のデータ へのアクセスを許可するには、上記のコードをアプリケーションのMETA-INF ディレクトリにあるcontext.xml に追加します。

   共有リソースの構成の場合は、上記のコードを $CATALINA_BASE/conf にあるcontext.xml に追加します。共有リソースの構成では、すべてのアプリケーションが FHIR に接続できるようになります。

3. アプリケーションの web.xml にリソースへの参照を追加します。

   
     FHIR のデータ JSP
     jdbc/FHIR
     javax.sql.DataSource
     Container
   
   

4. コネクションプールから接続を初期化します。

   Context initContext = new InitialContext();
   Context envContext  = (Context)initContext.lookup("java:/comp/env");
   DataSource ds = (DataSource)envContext.lookup("jdbc/FHIR");
   Connection conn = ds.getConnection();
     

Tomcat との連携について

上記の手順では、シンプルなコネクションプーリングのシナリオで FHIR のデータ に接続する方法を説明しました。その他のユースケースや詳細については、Tomcat のドキュメントに記載されている JNDI Datasource How-To を参照してください。