FHIR JDBC Driver を使用した OBIEE でのレポート作成
CData JDBC Driver for FHIR は、標準的なデータベースドライバーとして、Java ベースのレポーティングサーバーにFHIR のデータへのリアルタイムアクセスを統合できます。この記事では、Oracle Business Intelligence Enterprise Edition(OBIEE)にドライバーをデプロイし、変更がリアルタイムに反映されるFHIR のデータのレポートを作成する方法を説明します。
JDBC Driver のデプロイ
以下の手順で、JDBC Driver を WebLogic のクラスパスに追加します。
WebLogic 12.2.1 の場合、ドライバーの JAR ファイルと .lic ファイルを DOMAIN_HOME\lib に配置するだけで完了です(例:ORACLE_HOME\user_projects\domains\MY_DOMAIN\lib)。これらのファイルは起動時にサーバーのクラスパスに追加されます。
手動でクラスパスにドライバーを追加することもできます(以前のバージョンでは必須)。setDomainEnv.cmd(Windows)または setDomainEnv.sh(Unix)の PRE_CLASSPATH の先頭に以下を追加します。このスクリプトは、そのドメインのフォルダ内の bin サブフォルダにあります(例:ORACLE_HOME\user_projects\domains\MY_DOMAIN\bin)。
set PRE_CLASSPATH=your-installation-directory\lib\cdata.jdbc.fhir.jar;%PRE_CLASSPATH%
すべてのサーバーを再起動します(例:DOMAIN_HOME\bitools\bin の stop コマンドと start コマンドを実行)。
FHIR 用 JDBC データソースの作成
JDBC Driver をデプロイしたら、BI Publisher から JDBC データソースを作成できます。
- BI Publisher にログインします(URL は例えば http://localhost:9502/analytics)。Administration -> Manage BI Publisher をクリックします。
- JDBC Connection -> Add Data Source をクリックします。
- 以下の情報を入力します:
- Data Source Name:ユーザーがレポートで接続を作成する際に使用する名前を入力します。
- Driver Type:Other を選択します。
- Database DriverClass:ドライバークラス cdata.jdbc.fhir.FHIRDriver を入力します。
- Connection String:JDBC URL を入力します。
URL をFHIR サーバーのService Base URL に設定します。これは接続したいFHIR サーバーでリソースが定義されているアドレスです。ConnectionType をサポートされている接続タイプに設定します。ContentType をドキュメントのフォーマットに設定します。AuthScheme をFHIR サーバーの認証要件に基づいて設定します。
汎用、Azure ベース、AWS ベース、およびGoogle ベースのFHIR サーバー実装がサポートされます。
Service Base URL のサンプル
- 汎用:http://my_fhir_server/r4b/
- Azure:https://MY_AZURE_FHIR.azurehealthcareapis.com/
- AWS:https://healthlake.REGION.amazonaws.com/datastore/DATASTORE_ID/r4/
- Google:https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/
汎用FHIR インスタンス
CData 製品はFHIR のカスタムインスタンスへの接続をサポートします。カスタムFHIR サーバーへの認証はOAuth で行います(OAuth の詳細はヘルプドキュメントを参照してください)。カスタムFHIR インスタンスに接続する前に、ConnectionType をGenericに設定する必要があります。
組み込みの接続文字列デザイナー
JDBC URL の構築には、FHIR JDBC Driver に組み込まれた接続文字列デザイナーを使用できます。JAR ファイルをダブルクリックするか、コマンドラインから JAR ファイルを実行します。
java -jar cdata.jdbc.fhir.jar
接続プロパティを入力し、接続文字列をクリップボードにコピーします。
JDBC URL を構成する際、Max Rows 接続プロパティの設定も検討してください。これにより返される行数が制限され、レポートやビジュアライゼーションの設計時のパフォーマンス向上に特に役立ちます。
一般的な JDBC URL は以下のとおりです:
jdbc:fhir:URL=http://test.fhir.org/r4b/;ConnectionType=Generic;ContentType=JSON;AuthScheme=None;
- Username:ユーザー名を入力します。
- Password:パスワードを入力します。
- Security セクションで、許可するユーザーロールを選択します。
リアルタイム FHIR レポートの作成
これで、リアルタイムFHIR のデータに基づいたレポートや分析を作成できます。以下の手順で、標準のレポートウィザードを使用して、FHIR のデータの変更がリアルタイムに反映されるインタラクティブなレポートを作成します。
- グローバルヘッダーで、New -> Data Model をクリックします。
- Diagram タブで、メニューから SQL query を選択します。
- クエリの名前を入力し、Data Source メニューで作成した FHIR JDBC データソースを選択します。
- standard SQL を選択し、以下のようなクエリを入力します:
SELECT Id, [name-use] FROM Patient WHERE [address-city] = 'New York'
- View Data をクリックして、レポート作成に使用するサンプルデータを生成します。
- サンプルデータに含める行数を選択し、View をクリックしてから、Save As Sample Data をクリックします。
- Create Report -> Use Data Model をクリックします。
- Guide Me を選択し、Select Layout ページで含めるレポートオブジェクトを選択します。この例では Chart と Table を選択します。
- [name-use] のような数値カラムを Y 軸の Drop Value Here ボックスにドロップします。Id のようなディメンションカラムを X 軸の Drop Label Here ボックスにドロップします。
- Refresh をクリックすると、FHIR のデータの変更が反映されます。