エンタープライズサーチのNeuron にFHIR のデータを取り込んで検索利用

杉本和也
リードエンジニア

企業内検索エンジンサービスの Neuron にFHIR のデータを取り込んで検索する方法：CData JDBC Driver。

ブレインズテクノロジー社のNeuron は、先端OSS 技術（Apache Solr）を活用したエンタープライズサーチ（企業内検索エンジン）サービスです。Apache Solr は、エンタープライズサーチ機能をAPI として提供してくれますが、Neuron はApache Solr に企業ユーザーがデータを探索するためのシンプルかつ使いやすいユーザーインターフェースと管理画面・運用機能を提供してくれます。これによりエンドユーザーが簡単にエンタープライズサーチを利用することができます。管理画面では、ファイルやデータのクローリング設定がUI で行えるようになっています。この記事では、Neuron に備わっているJDBC インターフェース経由で、CData JDBC Driver for FHIR を利用することでNeuron にFHIR のデータを取り込んで検索で利用できるようにします。

Neuron にCData JDBC Driver for FHIR データをロード

CData JDBC Driver for FHIR のインストールと.jar ファイルの配置

CData JDBC Driver for FHIR をNeuron と同じマシンにインストールします。
以下のパスにJDBC Driver がインストールされます。
C:\Program Files\CData\CData JDBC Driver for FHIR 20xxJ\lib\cdata.jdbc.fhir.jar
このcdata.jdbc.fhir.jar とcdata.jdbc.fhir.lic ファイルをコピーして、Neuron のC:\APP cf\lib フォルダに配置します。

Neuron CF でのFHIR のデータを扱うリポジトリの作成

Neuron CF でクローラーの設定をGUI で行います。JDBC を読み取るためのリポジトリを作成します。Neuron の管理画面にログインし、［リポジトリ］→［リポジトリコレクション一覧］→［新規］をクリックします。
任意のリポジトリ名を入力します。タイプは［JDBC］を選択します。
次に、ドライバーのクラス名とJDBC 接続文字列でFHIR への接続を行います。

URL をFHIR サーバーのService Base URL に設定します。これは接続したいFHIR サーバーでリソースが定義されているアドレスです。ConnectionType をサポートされている接続タイプに設定します。ContentType をドキュメントのフォーマットに設定します。AuthScheme をFHIR サーバーの認証要件に基づいて設定します。

汎用、Azure ベース、AWS ベース、およびGoogle ベースのFHIR サーバー実装がサポートされます。

Service Base URL のサンプル
- 汎用：http://my_fhir_server/r4b/
- Azure：https://MY_AZURE_FHIR.azurehealthcareapis.com/
- AWS：https://healthlake.REGION.amazonaws.com/datastore/DATASTORE_ID/r4/
- Google：https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/
汎用FHIR インスタンス

CData 製品はFHIR のカスタムインスタンスへの接続をサポートします。カスタムFHIR サーバーへの認証はOAuth で行います（OAuth の詳細はヘルプドキュメントを参照してください）。カスタムFHIR インスタンスに接続する前に、ConnectionType をGenericに設定する必要があります。

ドライバクラス名：cdata.jdbc.fhir.FHIRDriver
接続文字列：jdbc:fhir:URL=http://test.fhir.org/r4b/;ConnectionType=Generic;ContentType=JSON;AuthScheme=None;
［更新］をクリックして、FHIR に接続するリポジトリコレクションができました。

Neuron でFHIR のデータをクローリングするジョブを作成

続いて、FHIR のどのデータをどのようにクローリングするのかをジョブで定義していきます。

管理画面で［ジョブ］→［ジョブ一覧］→［新規］とクリックします。
任意のジョブ名を入力します。出力先にはSolr を選択します。リポジトリは先ほど作成したFHIR に接続するリポジトリコレクションを選びます。
次に基本タブからジョブ実行を手動にするか、定期実行するかを自由に設定します。
SQL タブでは、どんなデータを取得するのか、テーブル名やカラム、フィルタリング条件などを設定できます。CData JDBC ドライバがFHIR のデータをテーブルにモデル化しているので、標準SQL でFHIR をクエリすることができます。
- SQL文：SELECT Id, [name-use] FROM Patient
- キーカラム：Id など取得テーブルのキーとなるカラム
- 検索対象カラム：検索の対象とするカラム
- タイトルカラム：検索結果のタイトルとするカラム
- タイムスタンプカラム：タイムスタンプとなるカラムがあれば、ここで指定します
リクエストパラメータでは、検索結果レコードのURL （があれば）を設定することもできます。URL を表示できると表示された検索結果からレコードに簡単に移動できます。
取得元では、ラベルを設定しておきます。［更新］をクリックして、クローラージョブの設定を完了します。