Informatica Enterprise Data Catalog で FHIR のデータを追加

Jerod Johnson
Senior Technology Evangelist

CData JDBC Driver for FHIR を Informatica Enterprise Data Catalog で使用し、データを分類・整理します。

Informatica は、データの転送と変換を行うための強力で洗練された手段を提供します。CData JDBC Driver for FHIR を使用すると、業界標準に準拠したドライバーを通じて Informatica Enterprise Data Catalog とシームレスに連携できます。このチュートリアルでは、あらゆる環境で FHIR データを分類・整理する方法を説明します。

JDBC ドライバーのロード

JDBC ドライバーをロードするには：

Informatica が動作しているホストに JDBC ドライバーをインストールします。この記事では、ドライバーが cdata.jdbc.fhir.FHIRDriver にインストールされていることを前提としています。

$ java -jar setup.jar

JDBC インストールディレクトリに移動し、ドライバーとそのライセンスファイルを含む genericJDBC.zip という名前の zip ファイルを作成します。

$ cd ~/cdata-jdbc-driver-for-fhir/lib
$ zip genericJDBC.zip cdata.jdbc.fhir.jar cdata.jdbc.fhir.lic

genericJDBC.zip ファイルを Informatica 内の Catalog Service ディレクトリに移動します。この記事では、Informatica が /opt/informatica にインストールされていることを前提としています。このフォルダでの作業には、おそらく root 権限が必要です。続行する前に、su または sudo で root に切り替えてください。

# mv genericJDBC.zip /opt/informatica/services/CatalogService/ScannerBinaries

zip ファイルを展開するために、カスタムデプロイメント設定を編集します。

# cd /opt/informatica/services/CatalogService/ScannerBinaries/CustomDeployer/
# nano scannerDeployer.xml

既存の ExecutionContextProperty ノードを展開した後、以下の内容で新しい ExecutionContextProperty ノードを追加します。


<ExecutionContextProperty
    isLocationProperty="true"
    dependencyToUnpack="genericJDBC.zip">
<PropertyName>JDBCScanner_DriverLocation</PropertyName>
<PropertyValue>scanner_miti/genericJDBC/Drivers</PropertyValue>
</ExecutionContextProperty>

Admin コンソールから Catalog Service をリフレッシュします。

Admin コンソールから Catalog Service をリフレッシュします。

JDBC リソースの設定

JDBC リソースを設定するには：

Catalog 管理画面を開き、以下のプロパティで新しい JDBC リソースを追加します：

Driver Class: cdata.jdbc.fhir.FHIRDriver
URL: jdbc.fhir:URL=http://test.fhir.org/r4b/;ConnectionType=Generic;ContentType=JSON;AuthScheme=None;

URL をFHIR サーバーのService Base URL に設定します。これは接続したいFHIR サーバーでリソースが定義されているアドレスです。ConnectionType をサポートされている接続タイプに設定します。ContentType をドキュメントのフォーマットに設定します。AuthScheme をFHIR サーバーの認証要件に基づいて設定します。

汎用、Azure ベース、AWS ベース、およびGoogle ベースのFHIR サーバー実装がサポートされます。

Service Base URL のサンプル

汎用：http://my_fhir_server/r4b/
Azure：https://MY_AZURE_FHIR.azurehealthcareapis.com/
AWS：https://healthlake.REGION.amazonaws.com/datastore/DATASTORE_ID/r4/
Google：https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/

汎用FHIR インスタンス

CData 製品はFHIR のカスタムインスタンスへの接続をサポートします。カスタムFHIR サーバーへの認証はOAuth で行います（OAuth の詳細はヘルプドキュメントを参照してください）。カスタムFHIR インスタンスに接続する前に、ConnectionType をGenericに設定する必要があります。

組み込みの接続文字列デザイナー

JDBC URL の構築については、FHIR JDBC Driver に組み込まれている接続文字列デザイナーを使用してください。.jar ファイルをダブルクリックするか、コマンドラインから .jar ファイルを実行します。

java -jar cdata.jdbc.fhir.jar

接続プロパティを入力し、接続文字列をクリップボードにコピーします。

組み込みの接続文字列デザイナーを使用して JDBC URL を生成（Salesforce の例）

JDBC URL を設定する際に、Max Rows 接続プロパティも設定することをお勧めします。これにより返される行数が制限され、レポートやビジュアライゼーションの設計時にパフォーマンスを向上させることができます。

一般的な追加の接続文字列プロパティは以下のとおりです：

JDBC;MSTR_JDBC_JAR_FOLDER=PATH\TO\JAR\;DRIVER=cdata.jdbc.fhir.FHIRDriver;URL={jdbc:fhir:URL=http://test.fhir.org/r4b/;ConnectionType=Generic;ContentType=JSON;AuthScheme=None;};