R から JDBC 経由でEnterpriseDBののデータを分析

R と Java がインストールされている環境であれば、純粋な R スクリプトと標準的な SQL を使用してEnterpriseDB のデータにアクセスできます。CData JDBC Driver for EnterpriseDB と RJDBC パッケージを使えば、R からリモートのEnterpriseDB のデータを操作できます。CData Driver を使用することで、業界で実績のある標準規格に準拠したドライバーを活用し、人気のオープンソース言語 R でデータにアクセスできます。この記事では、ドライバーを使ってEnterpriseDBに SQL クエリを実行し、標準的な R 関数を呼び出してEnterpriseDB のデータを可視化する方法を説明します。

R のインストール

マルチスレッドとマネージドコードによるドライバーのパフォーマンス向上を最大限に活かすには、マルチスレッド対応の Microsoft R Open を使用するか、BLAS/LAPACK ライブラリとリンクされたオープンソース R を使用します。この記事では Microsoft R Open 3.2.3 を使用しています。このバージョンは、2016年1月1日時点の CRAN リポジトリのスナップショットからパッケージをインストールするように事前設定されており、再現性が確保されています。

RJDBC パッケージの読み込み

ドライバーを使用するには、RJDBC パッケージをダウンロードしてください。 RJDBC パッケージをインストールしたら、以下のコードでパッケージを読み込みます。

library(RJDBC)

EnterpriseDBに JDBC データソースとして接続

EnterpriseDBに JDBC データソースとして接続するには、以下の情報が必要です。

• Driver Class: cdata.jdbc.enterprisedb.EnterpriseDBDriver に設定します。
• Classpath: ドライバー JAR ファイルの場所を設定します。デフォルトでは、インストールフォルダの lib サブフォルダです。

dbConnect や dbSendQuery などの DBI 関数は、R でデータアクセスコードを記述するための統一されたインターフェースを提供します。以下のコードで、CData JDBC Driver for EnterpriseDB に JDBC リクエストを行う DBI ドライバーを初期化します。

driver <- JDBC(driverClass = "cdata.jdbc.enterprisedb.EnterpriseDBDriver", classPath = "MyInstallationDir\lib\cdata.jdbc.enterprisedb.jar", identifier.quote = "'")

これで DBI 関数を使用してEnterpriseDBに接続し、SQL クエリを実行できます。dbConnect 関数で JDBC 接続を初期化します。

データに接続するには、以下の接続プロパティが必要です。

• Server: EnterpriseDB データベースをホスティングしているサーバーのホスト名またはIP アドレス。
• Port: EnterpriseDB データベースをホスティングしているサーバーのポート。

オプションで、以下を設定することもできます。

• Database: EnterpriseDB サーバーに接続する場合のデフォルトのデータベース。設定されていない場合は、ユーザーのデフォルトデータベースが使用されます。

Basic 認証による接続

Basic 認証を使って認証するには、以下を設定します。

• User：EnterpriseDB サーバーに認証する際に使われるユーザー。
• Password：EnterpriseDB サーバーに認証する際に使われるパスワード。

SSL 認証による接続

SSL 認証を利用して、セキュアなセッションを介してEnterpriseDB データに接続できます。以下の接続プロパティを設定して、データに接続します。

• SSLClientCert：クライアント証明書のための証明書ストア名に設定します。クライアントとサーバーの両方のマシンでトラストストアとキーストアが保持される2-way SSL の場合に使用されます。
• SSLClientCertPassword：クライアント証明書ストアがパスワードで保護されている場合、この値をストアのパスワードに設定します。
• SSLClientCertSubject：TLS/SSL クライアント証明書のSubject。ストア内の証明書を検索するために使用されます。
• SSLClientCertType：クライアントストアの証明書タイプ。
• SSLServerCert：サーバーが受け入れ可能な証明書。

組み込みの接続文字列デザイナー

JDBC URL の構築には、EnterpriseDB JDBC Driver に組み込まれている接続文字列デザイナーが便利です。JAR ファイルをダブルクリックするか、コマンドラインから JAR ファイルを実行してください。

java -jar cdata.jdbc.enterprisedb.jar

接続プロパティを入力し、接続文字列をクリップボードにコピーします。

以下は、一般的な JDBC 接続文字列を含む dbConnect 呼び出しの例です。

conn <- dbConnect(driver,"jdbc:enterprisedb:User=postgres;Password=admin;Database=postgres;Server=127.0.0.1;Port=5444")

スキーマの検出

このドライバーは、EnterpriseDB API をリレーショナルテーブル、ビュー、ストアドプロシージャとしてモデル化します。以下のコードでテーブルの一覧を取得できます。

dbListTables(conn)

SQL クエリの実行

dbGetQuery 関数を使用して、EnterpriseDB API でサポートされている任意の SQL クエリを実行できます。

orders <- dbGetQuery(conn,"SELECT ShipName, ShipCity FROM Orders WHERE ShipCountry = 'USA'")

以下のコマンドで、結果をデータビューアウィンドウに表示できます。

View(orders)

EnterpriseDB のデータのプロット

これで、CRAN リポジトリで利用可能なデータ可視化パッケージを使ってEnterpriseDB のデータを分析できます。組み込みのバープロット関数でシンプルな棒グラフを作成できます。

par(las=2,ps=10,mar=c(5,15,4,2))
barplot(orders$ShipCity, main="EnterpriseDB Orders", names.arg = orders$ShipName, horiz=TRUE)