R から JDBC 経由でCockroachDBののデータを分析

R と Java がインストールされている環境であれば、純粋な R スクリプトと標準的な SQL を使用してCockroachDB のデータにアクセスできます。CData JDBC Driver for CockroachDB と RJDBC パッケージを使えば、R からリモートのCockroachDB のデータを操作できます。CData Driver を使用することで、業界で実績のある標準規格に準拠したドライバーを活用し、人気のオープンソース言語 R でデータにアクセスできます。この記事では、ドライバーを使ってCockroachDBに SQL クエリを実行し、標準的な R 関数を呼び出してCockroachDB のデータを可視化する方法を説明します。

R のインストール

マルチスレッドとマネージドコードによるドライバーのパフォーマンス向上を最大限に活かすには、マルチスレッド対応の Microsoft R Open を使用するか、BLAS/LAPACK ライブラリとリンクされたオープンソース R を使用します。この記事では Microsoft R Open 3.2.3 を使用しています。このバージョンは、2016年1月1日時点の CRAN リポジトリのスナップショットからパッケージをインストールするように事前設定されており、再現性が確保されています。

RJDBC パッケージの読み込み

ドライバーを使用するには、RJDBC パッケージをダウンロードしてください。 RJDBC パッケージをインストールしたら、以下のコードでパッケージを読み込みます。

library(RJDBC)

CockroachDBに JDBC データソースとして接続

CockroachDBに JDBC データソースとして接続するには、以下の情報が必要です。

• Driver Class: cdata.jdbc.cockroachdb.CockroachDBDriver に設定します。
• Classpath: ドライバー JAR ファイルの場所を設定します。デフォルトでは、インストールフォルダの lib サブフォルダです。

dbConnect や dbSendQuery などの DBI 関数は、R でデータアクセスコードを記述するための統一されたインターフェースを提供します。以下のコードで、CData JDBC Driver for CockroachDB に JDBC リクエストを行う DBI ドライバーを初期化します。

driver <- JDBC(driverClass = "cdata.jdbc.cockroachdb.CockroachDBDriver", classPath = "MyInstallationDir\lib\cdata.jdbc.cockroachdb.jar", identifier.quote = "'")

これで DBI 関数を使用してCockroachDBに接続し、SQL クエリを実行できます。dbConnect 関数で JDBC 接続を初期化します。

CockroachDB 接続プロパティの取得・設定方法

CockroachDB に接続するには以下を設定します。

• Server：サーバーのホスト名またはIP アドレス。
• Port：CockroachDB サーバーのポート番号。デフォルトのポートは26257 です。
• Database：Cockroach データベースの名前。デフォルトでは、CData 製品はユーザーのデフォルトデータベースに接続します。
• User：認証に使用されるCockroach DB ユーザーアカウント。
• Password：ユーザーの認証で使用されるパスワード。

組み込みの接続文字列デザイナー

JDBC URL の構築には、CockroachDB JDBC Driver に組み込まれている接続文字列デザイナーが便利です。JAR ファイルをダブルクリックするか、コマンドラインから JAR ファイルを実行してください。

java -jar cdata.jdbc.cockroachdb.jar

接続プロパティを入力し、接続文字列をクリップボードにコピーします。

以下は、一般的な JDBC 接続文字列を含む dbConnect 呼び出しの例です。

conn <- dbConnect(driver,"jdbc:cockroachdb:User=root;Password=root;Database=system;Server=localhost;Port=26257")

スキーマの検出

このドライバーは、CockroachDB API をリレーショナルテーブル、ビュー、ストアドプロシージャとしてモデル化します。以下のコードでテーブルの一覧を取得できます。

dbListTables(conn)

SQL クエリの実行

dbGetQuery 関数を使用して、CockroachDB API でサポートされている任意の SQL クエリを実行できます。

orders <- dbGetQuery(conn,"SELECT ShipName, ShipCity FROM Orders WHERE ShipCountry = 'USA'")

以下のコマンドで、結果をデータビューアウィンドウに表示できます。

View(orders)

CockroachDB のデータのプロット

これで、CRAN リポジトリで利用可能なデータ可視化パッケージを使ってCockroachDB のデータを分析できます。組み込みのバープロット関数でシンプルな棒グラフを作成できます。

par(las=2,ps=10,mar=c(5,15,4,2))
barplot(orders$ShipCity, main="CockroachDB Orders", names.arg = orders$ShipName, horiz=TRUE)