ODBC 経由で R から Amazon Athena のデータ を分析

純粋な R スクリプトと標準 SQL で Amazon Athena のデータ にアクセスできます。CData ODBC ドライバ for Amazon Athena と RODBC パッケージを使用すると、R からリモート Amazon Athena のデータ を操作できます。CData ドライバを使用することで、業界で実績のある標準に準拠したドライバを活用し、人気のオープンソース言語 R でデータにアクセスできます。この記事では、ドライバを使用して Amazon Athena のデータ に SQL クエリを実行し、R で Amazon Athena のデータ を可視化する方法を説明します。

はじめに

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R をインストール

マルチスレッドや管理コードによるドライバのパフォーマンス向上は、マルチスレッド対応の Microsoft R Open や、BLAS/LAPACK ライブラリにリンクした R を実行することで補完できます。この記事では Microsoft R Open（MRO）を使用します。

Amazon Athena にODBC データソースとして接続

Amazon Athena への接続情報と、Windows および Linux 環境での DSN 設定手順を説明します。

Amazon Athena 接続プロパティの取得・設定方法

それでは、早速Athena に接続していきましょう。

データに接続するには、以下の接続パラメータを指定します。

• DataSource：接続するAmazon Athena データソース。
• Database：接続するAmazon Athena データベース。
• AWSRegion：Amazon Athena データがホストされているリージョン。
• S3StagingDirectory：クエリの結果を保存するS3 フォルダ。

Database またはDataSource が設定されていない場合、CData 製品はAmazon Athena の利用可能なデータソースからすべてのデータベースのリスト化を試みます。そのため、両方のプロパティを設定することでCData 製品のパフォーマンスが向上します。

Amazon Athena の認証設定

CData 製品は幅広い認証オプションに対応しています。詳しくはヘルプドキュメントの「はじめに」を参照してみてください。

AWS キーを取得

IAM ユーザーの認証情報を取得するには、以下のステップお試しください。

1. IAM コンソールにサインインします。
2. ナビゲーションペインでユーザーを選択します。
3. ユーザーのアクセスキーを作成または管理するには、ユーザーを選択してからセキュリティ認証情報タブに移動します。

AWS ルートアカウントの資格情報を取得するには、以下のステップをお試しください。

1. ルートアカウントの認証情報を使用してAWS 管理コンソールにサインインします。
2. アカウント名または番号を選択します。
3. 表示されたメニューでMy Security Credentials を選択します。
4. ルートアカウントのアクセスキーを管理または作成するには、Continue to Security Credentials をクリックし、［Access Keys］セクションを展開します。

その他の認証オプションについては、ヘルプドキュメントの「Amazon Athena への認証」を参照してください。

DSN を設定する際に、Max Rows 接続プロパティも設定することをお勧めします。これにより返される行数が制限され、レポートやビジュアライゼーションの設計時のパフォーマンス向上に役立ちます。

Windows

まだ設定していない場合は、ODBC DSN（データソース名）で接続プロパティを指定します。これはドライバーインストールの最後のステップです。Microsoft ODBC データソースアドミニストレーターを使用して、ODBC DSN を作成・設定できます。

Linux

Linux 環境で CData ODBC Driver for Amazon Athena をインストールする場合、ドライバーのインストール時にシステム DSN が事前定義されます。システムデータソースファイル（/etc/odbc.ini）を編集して、必要な接続プロパティを定義することで DSN を変更できます。

/etc/odbc.ini

[CData AmazonAthena Source]
Driver = CData ODBC Driver for Amazon Athena
Description = My Description
AccessKey = 'a123'
SecretKey = 's123'
Region = 'IRELAND'
Database = 'sampledb'
S3StagingDirectory = 's3://bucket/staging/'

これらの設定ファイルの使用方法の詳細については、ヘルプドキュメント（インストール済みまたはオンライン）を参照してください。

RODBC パッケージを読み込む

ドライバを使用するには、RODBC パッケージをダウンロードします。RStudio で、［ツール］ -> ［パッケージのインストール］をクリックし、［パッケージ］ボックスに RODBC と入力します。

RODBC パッケージをインストールした後、以下の行でパッケージを読み込みます。

library(RODBC)

注意：この記事では RODBC バージョン 1.3-12 を使用しています。Microsoft R Open を使用すると、Microsoft の MRAN リポジトリのチェックポイント機能を使用して同じバージョンでテストできます。 checkpoint コマンドを使用すると、MRAN リポジトリでホストされている CRAN リポジトリのスナップショットからパッケージをインストールできます。2016年1月1日のスナップショットにはバージョン 1.3-12 が含まれています。

library(checkpoint)
checkpoint("2016-01-01")

Amazon Athena のデータ にODBC データソースとして接続

以下の行で R から DSN に接続できます。

conn <- odbcConnect("CData AmazonAthena Source")

スキーマの検出

ドライバは Amazon Athena API をリレーショナルテーブル、ビュー、ストアドプロシージャとしてモデル化します。以下の行でテーブルの一覧を取得できます。

sqlTables(conn)

SQL クエリを実行

sqlQuery 関数を使用して、Amazon Athena API でサポートされている任意の SQL クエリを実行できます。

customers <- sqlQuery(conn, "SELECT Name, TotalDue FROM Customers", believeNRows=FALSE, rows_at_time=1)

以下のコマンドでデータビューアウィンドウに結果を表示できます。

View(customers)

Amazon Athena のデータ をプロット

これで、CRAN リポジトリで利用可能なデータビジュアライゼーションパッケージを使用して Amazon Athena のデータ を分析できます。組み込みのバープロット関数を使用して、シンプルな棒グラフを作成できます。

par(las=2,ps=10,mar=c(5,15,4,2))
barplot(customers$TotalDue, main="Amazon Athena Customers", names.arg = customers$Name, horiz=TRUE)